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癌症基因组计划网络

发布日期:2019.12.13 14:39:08

癌基因突变是高度异质性的,通过独立的癌症基因组计划获得广泛的人类恶性肿瘤全面的突变目录是很困难的。出国看病机构爱诺美康了解到,一些在全世界范围内协同进行癌症基因组测序计划的尝试,包括癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)和国际癌症基因组联盟(the International Cancer Genome Consortium,ICGC)。

此外,还有其他一些尝试聚焦在特殊肿瘤,如由孟菲斯圣犹大儿童研究医院和华盛顿大学的科学家们领导的对多种儿科肿瘤基因组测序的计划。TCGA于2006年启动,是由美国国立卫生研究院(NIH)支持的一个癌症基因组学的综合性研究计划。

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出国看病机构爱诺美康了解到,该计划更初主要聚焦在三种肿瘤:多形性胶质母细胞瘤(glioblastomamultiforme)、卵巢聚液性囊腺癌(serouscystadenocarcinomaoftheovary)和肺鱗癌(lungsquamouscarcinoma)。该研究已经在这些恶性肿瘤中获得了一些新的令人感兴趣的基因突变信息。在这些阳性成果的基础上,美国国立卫生研究院宣布了一项TCGA的扩展计划,目的是在未来几年至少获得20〜25种癌症的基因组数据。

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国际癌症基因组联盟(ICGC)成立于2008年,其目的是协同获得全世界更具临床和社会价值的50种不同的癌症或癌症亚型的全基因组异常的综合目录。该项目旨在对25000例癌症在基因组水平进行系统研究,并将这些信息与相同病例的表观基因组、转录组学信息,以及患者的临床资料进行整合分析。

目前,已有至少16个国家的69个确定的计划在ICGC协调下启动了。所有这些计划对影响人类各种器官和组织的肿瘤的每—种类型至少检测500例样品,包括血液、脑、乳房、食管、肾、肝、口腔、卵巢、胰腺、前列腺、皮肤和胃。

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这些计划都已为癌症突变基因目录提供了新的发现,并揭示了参与不同恶性肿瘤发展的致突变机制的特异性特征,包括致癌物的暴露或DNA修复缺陷。此外,这些癌症基因组研究也有助于确定临床上有关肿瘤亚型,用于预后和治疗评估,同时,有的研究已确定了用于癌症治疗的新的靶标和策略。

出国看病机构爱诺美康介绍,DNA测序技术的迅速发展将有可能使癌症基因组测序成本下降到目前价格的一小部分,并使研究人员能够克服目前全球性测序工作面临的限制。希望全世界癌症基因组计划的协作,包括泛癌症计划(Pan-Cancer Initiative),以及那些涉及细胞和动物模型中大规模的功能分析可能为我们提供迄今为止更全面的关于肿瘤病因及其分子机制方面的信息采集。


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