出国看病：预测结肠癌患者化疗益处的生物标志物

许多2期或3期结肠癌患者在手术后接受额外的或辅助的化疗。然而，临床试验表明，这种治疗并不能提高每个患者的生存机会。

迈阿密大学米勒医学院西尔威斯特综合癌症中心的研究员陈士骏博士正在利用他的数据专业知识来帮助解决这个问题。他领导了一项发表在《细胞报告医学》上的研究，该研究确定并验证了一种10基因生物标志物，该生物标志物可能预测2期或3期结肠癌患者是否将受益于辅助化疗。这一发现为进一步的研究奠定了基础，有朝一日，这一研究将允许患者和他们的医生做出个性化的治疗决定。

“当你谈论精确肿瘤学时，这意味着你使用单个患者的信息——这里我们特别谈论的是来自患者的生物标志物——来指导医生做出临床决定，确定哪种治疗对患者最合适，”陈博士说。“理想的情况是，我们只想对将从中受益的患者进行辅助化疗。对于没有反应的患者，我们仍然需要找到其他有效的治疗方法。”

作为一名数据科学家，米勒学院公共卫生科学系生物统计学教授陈博士将机器学习和人工智能应用于癌症研究，主要专注于结肠癌和乳腺癌。科学家们此前发现了一些生物标志物，可以帮助医生预测患者的生存曲线或了解癌症的侵袭性。陈博士说，

这些是有用的，但无助于指导治疗。因此，他和他在范德比尔特大学和纪念斯隆-凯特琳癌症中心的合作者开始寻找一种基因签名——一组特定的基因，其组合表达模式可以作为生物标记——这可能。“这对我们来说是一个真正的动力，”陈博士说。

结肠癌患者的肿瘤有许多不同的基因组图谱，因此该团队汇总了来自六个公开来源的基因表达谱，创建了一个933名患者的数据集，使其成为2期和3期结肠癌最大的基因表达数据集之一。陈博士说，该团队的数据科学家精心策划和执行质量控制，以确保他们能够识别准确的基因签名，以预测对化疗的反应。