美国看病:人体就像马赛克,许多组织都充满致癌突变
发布日期:2019.06.17 11:30:10
一项研究表明,人体就像马赛克,许多组织都充满致癌突变。美国看病机构爱诺美康了解到,该研究对29种不同类型组织的综合分析,人体就像是具有不同基因组的细胞的复杂“镶嵌”,其中许多携带可导致癌症的突变。

这是迄今为止规模Max的此类研究,从大约500人的数千个样本中收集数据。美国看病机构爱诺美康介绍,这项研究结果于6月6日发表在“科学”杂志上,帮助科学家更好地了解癌症如何开始以及如何更早地发现癌症。
“我们现在意识到我们是马赛克 - 我们体内的许多细胞已经携带了癌症突变,”Inigo Martincorena说,他是英国Hinckston的Wellcome Sanger研究所的遗传学家。“这些都是癌症的种子。”
美国看病机构爱诺美康介绍,组织镶嵌是由细胞积累的突变引起的 - 来自细胞分裂过程中潜入细胞的DNA突变,或暴露于紫外线或香烟烟雾等不良环境因素。当具有特定突变的皮肤细胞分裂时,它可能产生与相邻细胞在遗传上不同的皮肤。
以前的研究发现,皮肤,食道和血液中存在高度镶嵌性。这些结果通常通过对特定的显微组织样品进行测序而获得。
上述研究引起了波士顿马萨诸塞州综合医院计算生物学家Gad Getz的兴趣。 Getz和他的团队决定采用不同的方法 - 从基因型组织表达(GTEx)项目中挖掘RNA(RNA)序列数据库,而不是用微小的样本对DNA进行测序。由于人类使用DNA作为模板来产生RNA序列,因此DNA中的突变有时会反映在RNA中。
研究RNA的决定使Getz及其同事能够快速获得来自29个组织(约500人)的6,700个样本的数据。但他们的方法也有缺点。并非所有DNA都编码RNA,因此并非所有DNA突变都会出现在RNA序列中。由于GTEx该项目的样本规模相对较大,具有独特基因组的小细胞簇的DNA特征很可能被大量其他细胞所淹没。
美国看病机构爱诺美康介绍,总体而言,该研究发现,在某些类型的组织中,镶嵌现象在以前的研究中低于预期。但重点是,Martincorena说,较新的分析表明镶嵌现象存在于各种组织中。
研究人员指出,具有较高细胞分裂率的组织,例如构成皮肤和食道的组织,具有比具有较低细胞分裂率的组织更多的马赛克。马赛克也随着年龄增长而在肺和皮肤组织中尤为普遍 - 这些组织长时间暴露于环境因素并且可能对DNA造成损害。
例如,称为TP53的基因是经常见的突变位点之一。 TP53有助于修复DNA损伤,被称为“基因组监护人”。虽然TP53的某些变化与癌症有关,但在细胞产生肿瘤之前可能需要突变其他基因。
“我们所看到的是一些起初的癌前病变,后来会累积更多的突变,”加拿大温哥华不列颠哥伦比亚癌症研究所的癌症基因组学科学家Erin Pleasance说。 “结果,少数突变可能会成为癌症。”
马里兰州巴尔的摩市约翰霍普金斯医学院的应用数学家Cristian Tomasetti表示,研究人员现在需要找到方法来区分哪些细胞成为肿瘤,哪些细胞是“正常的”。这对于改善早期检测癌症的努力可能是至关重要的。
Tomasetti开发了一种检测血液中循环肿瘤DNA的方法,研究人员希望有一天它可以用来检测癌症的早期症状。但他说他的团队起初惊讶地发现研究中的一些突变来自一组正常的血细胞。这些突变与癌症有关,因此可能意味着存在肿瘤。
“这种混乱局面是新常态,”托马塞蒂说。 “现在的挑战是找到我们称之为正常的东西。”
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文章关键词:美国看病
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