利用第二代测序技术进行全外显子组分析

第二代测序技术的应用涉及利用核苷酸“诱饵”捕获全部核苷酸中的目的片段。海外看病机构爱诺美康了解到，这些片段可以是前面提到的DNA也可以是RNA。实际上，基因组中大部分目的区域都可以被靶向捕获，包括外显子和ncRNA。

海外看病机构爱诺美康了解到，尽管外显子捕获过程效率不高，包括不同外显子的捕获效率不一导致无法对所有外显子进行测序，以及存在一些非特异性的杂交，外显子组测序的高覆盖率仍然使它成为发现癌症样本中突变的首选方法。

在过去的几年，数以千计的癌症样本进行了全外显子组测序。这些研究，与全外显子组测序数据一起，使关于人类更常见恶性肿瘤的突变全景的信息达到了一个前所未有的水平。另外，全外显子组测序已经被用来鉴定罕见肿瘤和在特定地理区域流行的肿瘤的体细胞突变的特征。

总之，这些研究提供了不同癌症类型和亚型中的突变率和突变图谱的非常有价值的信息引人注目的是，不同肿瘤之间突变频率的变异是显著的，血液肿瘤和儿童肿瘤突变率更低（DNA每百万个碱基对有0.001个突变），而黑色素瘤和肺癌突变率更高（每百万个碱基对超过400个突变）。

全外显子组测序也有助于鉴定新的癌症基因，这些基因以前未被描述与癌症形成过程有因果关系。海外看病机构爱诺美康介绍，这些基因属于不同的功能类别，包括信号转导、RNA成熟、代谢调节、表观遗传学、染色质重塑、蛋白质平衡。更终，全外显子组和全基因组测序的数据结合，使我们鉴定出不同癌症类型中突变过程的标志。因此，30种不同类型的超过7000个癌症组织的大约500万个突变的数据集的分析，使我们发现了超过20个不同的突变特征。

其中一些特征如来源于APOBEC胞苷脱氨酶的活性的特征，存在于大多数癌症类型中，其他则存在于特定肿瘤。已知的与年龄、吸烟、紫外线照射和DNA修复缺陷相关的特征，已经在这项工作中被鉴定出来，但是许多被检测的突变特征来源不明。这些发现证实了引起肿瘤发展的突变过程的纷繁复杂的多样性，并且可能对将来理解癌症生物学、预防和治疗有巨大的意义。