癌症基因组分析的展望​

人类基因组计划的完成标志着生物医学科学的一个新开端。美国看病机构爱诺美康了解到，因为人类癌症是一种遗传性疾病，肿瘤学领域首先受到这场历史性革命的影响。对人类基因组序列和构成的了解使得可以系统地分析肿瘤起源和肿瘤演进的遗传改变。

美国看病机构爱诺美康介绍，常见肿瘤包括肺癌、皮肤癌、乳腺癌和结直肠癌的高通量突变分析，以及下一代测序技术应用于癌症样本的全基因组、全外显子组及全转录组分析，这些通过检测所有主要类型的体细胞癌基因组改变，使人们对这一疾病的了解有了实质性的进展。

驱动基因的遗传改变

这些带来了历史性的成果，如鉴定这些疾病的主要驱动基因的遗传改变。然而，癌症的遗传全景还绝不完善，迄今为止我们已经了解但又产生了新的问题亟待解决。体细胞突变的检测仍然面临着重要的技术挑战。与外周血样本进行生殖细胞基因组研究相似性的分析相比，临床肿瘤样品通常含有大量的非恶性细胞，这使得癌症基因组突变的识别更具挑战性。

此外，癌症发展和进程中所固有的基因组不稳定性大大增加了恶性肿瘤的基因组改变的复杂性和多样性，使得有必要区分“驱动”突变和“乘客”突变。

同样的，恶性肿瘤在遗传上具有异质性，并且在同一肿瘤内包含多个克隆的同时生长，这就引发了关于目前从癌症基因组中获得的信息质量的另外一些问题。希望在不久的将来，第三代测序技术的进展将使从单个细胞中分离出的基因组获得高质量的序列数据成为可能，这是癌症研究的一个重要方面。

癌基因组图谱

下一个当务之急是对所有癌症类型的癌基因组图谱的定义。特别是那些不常见的、但是致命性并不弱的癌症，这些疾病对科学家来说依然神秘，对临床医生来说仍是无法治愈的。对于这些疾病，在过去几年中几乎没有发现任何新的可以用于治疗的分子靶点。例如，与胰腺癌和卵巢癌相关的可用于药物靶点的遗传性病变的鉴定可能会对这些侵袭性疾病的新的治疗策略的确定有所帮助。为了实现这一目标，必须勾画相应肿瘤详细的癌基因组图谱。由于目前正在系统进行癌症基因组计划，后者有望在未来几年内完成。

即使在常见癌症病例中，仍有许多基因组分析工作需要进行。例如，在很大一部分乳腺癌和肺癌中，发挥驱动作用的突变还未被发现。这并不奇怪，到目前为止即使在这些肿瘤类型中，也只有有限数量的样本已被系统地分析过。因此，在一些肿瘤亚型中，某些低频发生的代表关键治疗靶点的突变可能没有被检测到。因此，有必要对每种肿瘤类型的突变谱扩大样本量分析。

癌症等位基因

美国看病机构爱诺美康介绍，几百个新近发现的癌症等位基因赋予的细胞特性是另一个必须发展的领域。事实上，与基因组发现阶段相比，新的假定的癌症等位基因的功能验证，尽管具有强大的临床相关性，但远远滞后了。为了实现这一点，必须发展模式生物系统中高通量的功能研究，可以准确概括人类癌症中发现的遗传变异。

总而言之，分析癌症基因组的更终目标不仅仅是进一步了解疾病的分子基础，也是发现新型诊断和药物的靶标。人们可能会预料到，这些新技术的更直接应用将是无创性早期癌症检测的策略。

考虑到致癌突变仅存在于癌细胞中，筛选患者血液中的肿瘤衍生突变体DNA具有很大的潜力，并将逐步替代目前的敏感性差、缺乏特异性的生物标志物。进一步改进新一代测序技术可能会降低成本，并使这些分析在未来变得更容易。一旦这种情况发生，大多数癌症患者就会接受深人的基因组分析作为他们更初评价和整个治疗的一部分。这将提供更精确的诊断和预后信息，影响治疗决定。尽管存在许多挑战，但从新一代测序平台获得的信息正在为个性化医疗奠定基础，针对患者肿瘤中发现的特异性基因突变而定制的方法用于患者的治疗。结果，与伊马替尼在CML患者PLX4032在黑色素瘤患者,以及吉非替尼和厄洛替尼在NSCLC患者获得的成功相似，这些应该也会带来治疗上的成功。显然，这是所有此类工作的绝对目标。