前列腺癌的基因组与前列腺癌分子亚型框架的研究

新一代测序技术的到来显著拓宽了我们对于前列腺癌基因组概貌的理解。美国看病机构爱诺美康了解到，近期的一些研究定性了来自75个患者的全部前列腺癌基因组，并报道了几百个其他病例的外显子组结合基因表达和既往从几千个肿瘤获得的拷贝数数据，这些研究提供了相对广泛的前列腺癌基因组和转录组的轮廓。与其他上皮肿瘤相同，前列腺癌含有基因组水平的病变，如扩增和缺失、点突变和转位，以及导致癌基因过表达和抑癌基因低表达的转录变化。

美国看病机构爱诺美康介绍，有数据显示，肿瘤的一个亚群含有复发性的扩增和从局部改变（一到几个基因）到跨越整个染色体的其他形式的缺失。这些变化有随着更高的分级和阶段而发生率增加的倾向。

普遍的缺失发生在染色体8p、10q和13q,并包括基因如NKX3.1、PTEN和RB1。转移性肿瘤包含染色体X和8q的扩增，包括雄激素受体（AR)和MYC癌基因。

尽管前列腺癌基因组表现出总体上的较低突变率（约1/MB)，前列腺癌概貌也可以通过拷贝数和几个关键癌基因和抑癌基因通路的突变性改变来定义，通常当每一通路中的单个基因被一起考虑时会涉及。其中三条通路——AR通路、PI3K/AKT通路和RB通路，在超过1/3的原发癌和绝大多数转移性病灶中发生改变。这些通路的频繁改变表明，在前列腺癌中，通路上不同的基因可被靶向，以激活或抑制一个常见通路的损伤。

美国看病机构爱诺美康介绍，除了基于通路的分析，前列腺癌可按照单一基因的常见变化来定义。约50%的前列腺特异性抗原（PSA)筛选过的前列腺癌含有包括E26转化特异性（ETS)转录因子的基因融合，代表着致癌性的驱动因子。令人惊讶的是，ETS融合和特定的其他损伤，如E3泛素连接酶SPOP突变和包括RAF的融合，看起来相互排斥，暗示一种前列腺癌分子亚型框架的存在。