HPV与宫颈癌的风险程度相关

在中高病理分级的宫颈发育不良观察到的改变，与这些基因产物在早期HPV诱导的宫颈癌中发挥作用的假设一致。海外看病机构爱诺美康了解到，特定序列的差异与极终发展为宫颈癌的风险程度相关。例如，证据表明，在德裔犹太人（Ashkenazi)人群中发现的E6序列发挥保护性的优势，对抗宫颈癌的发展，以前这种抑制作用被认为是割礼引起的。虽然对于其他早期基因了解要少得多，如E2,但其也被认为与转化相关。

海外看病机构爱诺美康了解到，在分子水平上，E6和E7干扰细胞周期，细胞凋亡的重要控制机制与p53和pRb直接相互作用干扰维持染色体稳定的控制机制。此外，极近的研究表明，这两个病毒癌蛋白联合扰乱有丝分裂过程中染色体复制和分离机制，从而诱发与中心体异常、后期桥、染色体滞后和断裂相关的严重的染色体不稳定性。它们也被证明与其他细胞的蛋白交互作用，这些蛋白在上皮转化中的作用不明确，包括转录共激活因子（如p300)、交界复合物组成部分（如hDlgl)。

除了HPV、PIK3CA、PTEN、TP53、STK11和KRAS的体细胞突变，以及几个拷贝数改变也参与了宫颈癌的发病机制。近期的一项研究包括对115例宫颈癌-正常配对样本进行了全外显子测序，79例进行转录组测序，14例肿瘤-正常配对样本的全基因组测序。

在该研究中，在79例原发性鳞状细胞癌中发现了以前未知的体细胞突变，包括反复发生的MAPK1基因中的E322K置换（8%)，HLA-B基因的失活突变（9%)和EP300(16%)、FBXW7(15%)、NFE2L2(4%)、TP53(5%)和ERBB2(6%)的突变。此外，在24个腺癌中还发现ELF3(13%)和CBFB(8%)体细胞突变。

总体而言，与腺癌相比，鳞状细胞癌具有较高频率的体细胞胞嘧啶核苷酸置换，这个胞嘧啶存在于胸腺嘧啶之前（Tp*C位点）。HPV整合位点在一些脆性位点，以及之前报道的基因包括MYC、ERBB2、TP63、FANCC、RAD51B和CEACAM5的内部或附近。HPV整合比预期更接近扩增区域，21/51(41%)的整合位点与扩增区域重叠支持病毒的整合可能引起基因组扩增的假说。有趣的是，在某些肿瘤反复发生HPV整合到RAD51B位点，涉及HPV16、HPV18和HPV52。