爱诺头条新闻动态 实施全基因组测序的重要性,癌症的演进!

实施全基因组测序的重要性,癌症的演进!

发布日期:2019.12.13 10:07:42

鉴定体细胞调控序列的突变(这些突变也能引起肿瘤发生),强调了实施全基因组测序的重要性。美国就医机构爱诺美康了解到,一项研究检查了19个黑色素瘤全基因组样品的非编码突变,揭示了其中的17个病例的端粒酶反转录酶(TERT)启动子区的2个频发突变。

实施全基因组测序的重要性,癌症的演进!

当对这2个突变的研究扩展到另外51个肿瘤和它们对应的正常组织,观察到33个肿瘤有2个突变中的1个,而且这2个突变的出现互相排斥。美国就医机构爱诺美康介绍,这2个突变引起含有ETS转录因子共有结合位点的11个相同碱基对的核苷酸延伸。当这些突变被克隆进荧光素酶报告基因实验系统中,使启动子转录活性在5个黑色素瘤细胞系中增高2〜4倍。

虽然这种变异在黑色素瘤中更加频繁,但是也存在于其他癌症类型中,因为在癌细胞系大全(Cancer Cell Line Encyclopedia)中列出的癌症中16%有两个TERT突变中的一个。

总起来说,这些TERT突变比BRAF和NRAS激活的突变更加常见。两个TERT突变互相排斥,并且出现在没有表现出很大背景突变率的区域,表明这些突变对于肿瘤发生是重要的“驱动”事件。

另外一项更近的研究在家族性黑色素瘤患者生殖细胞中确认了这两个突变,进一步支持了这个观点。

美国就医机构爱诺美康介绍,正如TERT启动子突变的发现表现的那样,不编码蛋白质的基因组区域对我们了解肿瘤形成和进展的生物学机制同样非常重要。

基因组中另一类非编码蛋白质区域是非编码RNA(non codingRNA)。一类非编码RNA是小RNA(miRNA)。

miRNA发现于20年前,在一个组织中表达或者以特异性发育方式表达,并且它们的表达和癌症相关通路如凋亡或应激反应一起,能影响细胞生长和分化。

miRNA发挥这一作用,可通过过表达导致靶向和下调肿瘤抑制基因,或者相反,通过miRNA自身下调导致靶向的癌基因增加表达。

miRNA已经在癌症中被广泛研究,并且它们的功能在许多癌症中被观察到,仅举几个例子,如神经胶质瘤和乳腺癌。


文章关键词:全基因组测序癌症

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