搜寻其他激酶驱动的癌症，开发新靶标药物的潜力

自动化基因测序的发展，使我们有可能通过一种强有力的方法来分析是否在人类癌症中可能存在这样的突变。出国医疗机构爱诺美康了解到，开拓新的范例,搜寻其他激酶驱动的癌症，尽管意外的发现带来了好处，在有突变或药物靶标扩增的肿瘤中激酶抑制剂治疗成功的例子越来越多，这就要求有更合理的方法来发现药物和进行药物开发。

2002年，已知的有激酶突变的人类肿瘤还很少，要综合回答这个问题，我们就要对每种肿瘤类型的数百个样品中的激酶进行基因组测序。出国医疗机构爱诺美康了解到，几个早期的试验研究证明了这种方法在揭示药物开发的重要新靶标的潜力。

也许引人注目的是在一半以上的黑色素瘤患者，以及结肠和甲状腺癌中的一小部分患者发现有BRAF激酶突变。另外就是在几乎所有的真性红细胞增多症患者、大部分骨髓纤维化和原发性血小板增多症患者中发现Janus相关的酪氨酸激酶突变。第三个例子就是在多种肿瘤中鉴定了PIK3CA突变，突变频率高的是乳腺癌、子宫内膜癌和大肠癌。PIK3CA编码一种脂质激酶，产生第二信使磷脂酰肌醇-3-磷酸（PIP3)。PIP3通过AKT激酶家族及其他下游效应分子激活生长和生存信号。加上已经确认的PTEN(磷酸酶和与张力蛋白同源）脂质磷酸酶去磷酸化PIP3作用，PIK3CA突变的发现使这条通路的多个抑制剂的发展引起了巨大的关注。

这些重要发现中的每一个，BRAF、JAK2、PIK3CA均来自相对较小的试验（不到100个肿瘤），这些试验重点放在其他激酶已发现有突变的（通常是近膜及激酶结构域）编码激酶区域的外显子的重新测序。这些规模有限的搜寻大部分使用Sanger测序法，花费高昂。

2006年，在100种肿瘤中将所有激酶的所有外显子的测序可以很轻易地超过数百万美元。出国医疗机构爱诺美康介绍，因为风险/回报比率过高，这些项目不容易通过传统的筹资机构获得财政支持。而且，样品采集所需的大量硬件基础设施，将肿瘤组织和正常组织分开的显微切割、核酸制备、高通量的自动测序及实验结果的计算机分析都很重要。能应对这些挑战的配备完善的机构极少。

作为回应，美国国家癌症研究所（与国家人类基因组研究所合作）和ICGC启动了一个高通量的研究尝试，为成千上万的癌症进行全基因组测序。同时，下一代测序技术导致成本大量减少，使对更多肿瘤做更全面的分析成为可能。美国的癌症基因组图谱（TCGA)已上传29种不同类型肿瘤的数据。该国际小组已承诺测序代表50个不同的癌症亚型的25000例肿瘤。这两个团队将已测出的所有序列信息免费向科学界立即开放，使整个科学界可以从数据中获益。这一政策从癌症基因组总体出发，广泛分析癌症突变，为癌症研究人员和药物开发商组织提供了蓝图。