新一代测序（NGS)技术被应用于肝细胞癌的研究

研究显示，复杂的新一代测序（NGS)技术现在被应用于癌症研究。出国看病机构爱诺美康介绍，新一代测序（NGS)技术用于在单核苷酸分辨率水平上对癌症基因组进行全面地和经济地分析，在转化医学上已经发展成有价值的工具。

出国看病机构爱诺美康了解到，像肝细胞癌HCC这样的实体瘤的NGS的实施充满了挑战，因为在一个样本内的正常细胞或基质成分的比例构成了基因组信息，因此可能需要更高的覆盖度（即阅读深度）。并且，HCC常产生于有慢性肝脏疾病的患者，如肝硬化、肝纤维化、HBV感染或HCV感染，当比较肿瘤周边肝组织甚至血液时，这些慢性疾病使肿瘤/正常变异的发现复杂化了。因此，NGS技术——尤其是全基因组测序——目前应用到肝细胞癌的研究上的数目有限，只用在少量患者。

出国看病机构爱诺美康介绍，所有研究表明，肝细胞癌HCC中分子变异谱是相对广泛的，每个肿瘤的突变数为5〜121。因此，由于遗传异质性，HCC发展中的多个突变被认为发生相当复杂的交互作用。虽然癌基因成瘾性还没有被证实，p53和Wnt/β-联蛋白信号通路中有大量突变被检测到。因此，深入分析的结果更加证明了P53和Wnt/β-联蛋白信号通路是参与HCC发展的极常见的分子改变之一。

出国看病机构爱诺美康介绍，另一个有趣的发现是，涉及染色质重塑的基因发生高频基因改变。总之，16%〜24%的HCC在这些通路中表现出遗传改变，因此表明了其与肝细胞转化的因果关系，并且为HCC发生中表观遗传学的关键作用提供了新证据。

两项近来的全外显子/全基因组测序研究了87和88个HCC及配对正常组织，证实了既往的研究，即β-联蛋白（10%和]5.9%)和TP53(18%和35.2%)分别是HCC中突变频率极高的癌基因和抑癌基因。Kan等的这项研究也发现了几个可用于药物治疗的突变，包括Janus激酶1(9.1%)的激活突变，这可能为新的个性化治疗干预提供了一个选择。有趣的是，Nault等使用传统的Sanger法测序，鉴定出激活端粒酶反转录酶的体细胞突变，是癌前病变（25%)及肝癌（59%)中极早极常见的突变，并且与CTNNB1激活突变有关。