美国肉瘤新的靶向治疗方案的研究

美国一项研究报道，在美国每年死于肉瘤的患者约5800例，研究新的靶向治疗方案迫在眉睫。出国看病机构爱诺美康了解到，鉴定每种肉瘤亚型中驱动基因突变是关键的挑战。一旦这些驱动子改变被明确，联合功能筛选、高通量化合物筛选、组合化学及结构生物学信息就能获得新的小分子来靶向这些驱动突变。

美国新一代测序技术的高速发展极大地拓宽了我们对特定肿瘤中各亚型的突变、易位、表观遗传改变及异常的信号通路等的认识。

同时，美国大量的测序实验及整合分析使我们能够对包括拷贝数变化、结构重排、表达密码子突变、选择性剪切类型、数字基因表达谱、嵌合转录本及DNA甲基化位点在内的各种变化进行整体基因组分析。出国看病机构爱诺美康介绍，这种方法比以往的任何方法更能为肿瘤基因组分析提供一个更深层次的视角。

以单个肿瘤为例，我们可以对人类基因组的所有蛋白编码区域进行重测序得到详细的转录组信息（RNA-seq),然后用其他基于测序的方法（如染色质免疫沉淀测序、甲基化测序、DNA酶测序等）来对表观基因标记及染色质结构进行全基因组分析。

关于基因表达的研究，美国以基因芯片为主的研究手段正被以测序为基础的方法替代，因为RNA-seq能为要研究的基因提供更加精确的如转录本水平、选择性剪切、序列突变等方面的信息。RNA-seq还有一个附加优势，那就是即使在完全不知道某个基因的情况下，它依然能够识别一些罕见的转录本。出国看病机构爱诺美康介绍，如果将测序结果与人类肉瘤组织中发现的发生遗传学改变的细胞系中进行高通量RNA干扰筛选所得的数据进行整合，那将大大加强鉴定和靶向肉瘤发生的相关信号通路和蛋白的能力。

我们可以利用高通量生物化学方法筛选低亲和力化合物，结合敏感的生物物理技术如磁共振、X射线衍射及蛋白配体晶体学等设计能表现靶蛋白三维结构的化合物，由此产生的与物理化学相关的数据能促进与药效基因相匹配的三维结构库的虚拟筛选，同时能够加快我们对一些靶向肿瘤发生相关的信号通路的选择性小分子抑制剂的开发。